アカウントごとに開きなおすたびに異なるQRコードが表示され、同じQRコードは二度と表示されません

そのため、認証アプリにアカウントを登録して6桁の認証コードが作成されてもその際のバーコード・キーが表示された設定画面で登録せずに閉じてしまうと次に再度QRコード画面表示がされたときには異なるアカウント用になります。

設定が完了する前では2要素認証設定画面は閉じないようにしてください。